一种基于Indel和SSR位点技术大批量且高效开发分子标记的方法
申请号:201610072778.2
专利名称:一种基于Indel和SSR位点技术大批量且高效开发分子标记的方法
申请日期?016-02-02
专利类型:发明授?/p>
申请(权利)人: 中国水产科学研究院南海水产研究所
发明人:张殿?朱克?刘田?江世?张楠,郭华?/p>
公开(公告)号:CN 105695572B
公开(公告)日期?021-02-23
摘要:本发明公开了一种基于Indel和SSR位点技术大批量且高效开发分子标记的方法,包括以下步骤:(1)选取至少3个待开发样品,分别提取待开发样品的DNA?2)对各待开发样品的DNA样品进行酶切并构建测序文库并测序?3)所有待开发样品的基因组混合后进行组装获得Contigs?4)利用Contigs与各待开发样品个体序列进行比对,根据Indel和SSR的位点信息,获得内部存在Indel的SSR位点,作为候选多态性SSR位点?5)根据获得的候选多态性SSR位点设计引物,PCR扩增和测序,选取带型稳定清晰条带,作为待验证分子标记引物?6)利用所得的分子标记引物,PCR扩增不同的待开发样品,选取具有多样性的分子标记,获得分子标记。该方法提高分子标记开发的效率,且开发的SSR分子标记能高效应用于遗传学、增殖放流评估等方面的研究?/p>
微信扫一?br>分享到朋友圈


粤公网安?4010502001742?/a>