?!DOCTYPE html> 一种基于Indel和SSR位点技术大批量且高效开发分子标记的方法-南海水产研究所

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一种基于Indel和SSR位点技术大批量且高效开发分子标记的方法

撰写时间?021-11-16 [来源:南海水产研究所 ]

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申请号:201610072778.2  

专利名称:一种基于Indel和SSR位点技术大批量且高效开发分子标记的方法

申请日期?016-02-02

专利类型:发明授?/p>

申请(权利)人: 中国水产科学研究院南海水产研究所

发明人:张殿?朱克?刘田?江世?张楠,郭华?/p>

公开(公告)号:CN 105695572B

公开(公告)日期?021-02-23

摘要:本发明公开了一种基于Indel和SSR位点技术大批量且高效开发分子标记的方法,包括以下步骤:(1)选取至少3个待开发样品,分别提取待开发样品的DNA?2)对各待开发样品的DNA样品进行酶切并构建测序文库并测序?3)所有待开发样品的基因组混合后进行组装获得Contigs?4)利用Contigs与各待开发样品个体序列进行比对,根据Indel和SSR的位点信息,获得内部存在Indel的SSR位点,作为候选多态性SSR位点?5)根据获得的候选多态性SSR位点设计引物,PCR扩增和测序,选取带型稳定清晰条带,作为待验证分子标记引物?6)利用所得的分子标记引物,PCR扩增不同的待开发样品,选取具有多样性的分子标记,获得分子标记。该方法提高分子标记开发的效率,且开发的SSR分子标记能高效应用于遗传学、增殖放流评估等方面的研究?/p>

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